MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11 plasmid 2

Total Repeats: 91

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008504	ATAA	2	8	78	85	75 %	25 %	0 %	0 %	116326541
2	NC_008504	TAT	2	6	120	125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326541
3	NC_008504	AT	3	6	135	140	50 %	50 %	0 %	0 %	116326541
4	NC_008504	TAT	2	6	147	152	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326541
5	NC_008504	TTA	2	6	155	160	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326541
6	NC_008504	TTTA	2	8	196	203	25 %	75 %	0 %	0 %	116326541
7	NC_008504	TCT	2	6	227	232	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326541
8	NC_008504	ATT	2	6	271	276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326541
9	NC_008504	CATTC	2	10	315	324	20 %	40 %	0 %	40 %	116326541
10	NC_008504	ATT	2	6	367	372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326541
11	NC_008504	T	9	9	371	379	0 %	100 %	0 %	0 %	116326541
12	NC_008504	TAT	2	6	405	410	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326541
13	NC_008504	TTTA	2	8	484	491	25 %	75 %	0 %	0 %	116326541
14	NC_008504	AAAT	2	8	502	509	75 %	25 %	0 %	0 %	116326541
15	NC_008504	TAAT	2	8	525	532	50 %	50 %	0 %	0 %	116326541
16	NC_008504	TAAA	2	8	565	572	75 %	25 %	0 %	0 %	116326541
17	NC_008504	CA	3	6	600	605	50 %	0 %	0 %	50 %	116326541
18	NC_008504	TAA	2	6	613	618	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326541
19	NC_008504	TGT	2	6	626	631	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116326541
20	NC_008504	T	6	6	667	672	0 %	100 %	0 %	0 %	116326541
21	NC_008504	ACTA	2	8	691	698	50 %	25 %	0 %	25 %	116326541
22	NC_008504	ACG	2	6	934	939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116326542
23	NC_008504	CAA	2	6	949	954	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116326542
24	NC_008504	CTCTA	2	10	972	981	20 %	40 %	0 %	40 %	116326542
25	NC_008504	GAA	2	6	1050	1055	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326542
26	NC_008504	A	7	7	1067	1073	100 %	0 %	0 %	0 %	116326542
27	NC_008504	AGTG	2	8	1102	1109	25 %	25 %	50 %	0 %	116326542
28	NC_008504	TAAT	2	8	4416	4423	50 %	50 %	0 %	0 %	116326543
29	NC_008504	AAATTT	2	12	4432	4443	50 %	50 %	0 %	0 %	116326543
30	NC_008504	A	7	7	4520	4526	100 %	0 %	0 %	0 %	116326543
31	NC_008504	ACAA	2	8	4545	4552	75 %	0 %	0 %	25 %	116326543
32	NC_008504	T	6	6	4558	4563	0 %	100 %	0 %	0 %	116326543
33	NC_008504	A	6	6	4576	4581	100 %	0 %	0 %	0 %	116326543
34	NC_008504	TAT	2	6	4582	4587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326543
35	NC_008504	TTA	2	6	4600	4605	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326543
36	NC_008504	T	6	6	4606	4611	0 %	100 %	0 %	0 %	116326543
37	NC_008504	ATT	2	6	4631	4636	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326543
38	NC_008504	TGG	2	6	4672	4677	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116326543
39	NC_008504	TACT	2	8	4711	4718	25 %	50 %	0 %	25 %	116326543
40	NC_008504	A	6	6	4735	4740	100 %	0 %	0 %	0 %	116326543
41	NC_008504	AGG	2	6	4745	4750	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116326543
42	NC_008504	T	6	6	4751	4756	0 %	100 %	0 %	0 %	116326543
43	NC_008504	TAT	2	6	7105	7110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326544
44	NC_008504	A	7	7	7134	7140	100 %	0 %	0 %	0 %	116326544
45	NC_008504	GGT	2	6	7141	7146	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116326544
46	NC_008504	GAAA	2	8	7156	7163	75 %	0 %	25 %	0 %	116326544
47	NC_008504	TCA	2	6	7197	7202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326544
48	NC_008504	TAT	2	6	7299	7304	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326544
49	NC_008504	T	7	7	7324	7330	0 %	100 %	0 %	0 %	116326544
50	NC_008504	AAG	2	6	7365	7370	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326544
51	NC_008504	A	6	6	7377	7382	100 %	0 %	0 %	0 %	116326544
52	NC_008504	T	7	7	7396	7402	0 %	100 %	0 %	0 %	116326544
53	NC_008504	AAG	2	6	7410	7415	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326544
54	NC_008504	GAAA	2	8	7537	7544	75 %	0 %	25 %	0 %	116326544
55	NC_008504	ATT	2	6	7598	7603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326544
56	NC_008504	G	6	6	7658	7663	0 %	0 %	100 %	0 %	116326544
57	NC_008504	A	7	7	7783	7789	100 %	0 %	0 %	0 %	116326544
58	NC_008504	GAA	2	6	7796	7801	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326544
59	NC_008504	A	6	6	7844	7849	100 %	0 %	0 %	0 %	116326544
60	NC_008504	ATA	2	6	7863	7868	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326544
61	NC_008504	GAA	2	6	7885	7890	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326544
62	NC_008504	AAG	2	6	7938	7943	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326544
63	NC_008504	AGA	2	6	7966	7971	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326544
64	NC_008504	AAG	2	6	8169	8174	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326544
65	NC_008504	GAA	2	6	8206	8211	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326544
66	NC_008504	TGAAA	2	10	8267	8276	60 %	20 %	20 %	0 %	116326545
67	NC_008504	AGG	2	6	8303	8308	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116326545
68	NC_008504	ATTT	2	8	8309	8316	25 %	75 %	0 %	0 %	116326545
69	NC_008504	AGG	2	6	8348	8353	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116326545
70	NC_008504	TA	4	8	8384	8391	50 %	50 %	0 %	0 %	116326545
71	NC_008504	TAT	3	9	8399	8407	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326545
72	NC_008504	T	7	7	8413	8419	0 %	100 %	0 %	0 %	116326545
73	NC_008504	A	7	7	8424	8430	100 %	0 %	0 %	0 %	116326545
74	NC_008504	ATTT	2	8	8480	8487	25 %	75 %	0 %	0 %	116326545
75	NC_008504	TAA	2	6	8494	8499	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326545
76	NC_008504	GATATT	2	12	8558	8569	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	116326545
77	NC_008504	T	6	6	8571	8576	0 %	100 %	0 %	0 %	116326545
78	NC_008504	T	6	6	8595	8600	0 %	100 %	0 %	0 %	116326545
79	NC_008504	CT	3	6	8668	8673	0 %	50 %	0 %	50 %	116326545
80	NC_008504	TAT	2	6	8714	8719	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326545
81	NC_008504	TTAA	2	8	8727	8734	50 %	50 %	0 %	0 %	116326545
82	NC_008504	AT	3	6	8890	8895	50 %	50 %	0 %	0 %	116326546
83	NC_008504	CTA	2	6	8918	8923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326546
84	NC_008504	ATAA	2	8	9128	9135	75 %	25 %	0 %	0 %	116326546
85	NC_008504	AAAC	2	8	9170	9177	75 %	0 %	0 %	25 %	116326546
86	NC_008504	AGA	2	6	9232	9237	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326546
87	NC_008504	CAAT	2	8	9310	9317	50 %	25 %	0 %	25 %	116326546
88	NC_008504	A	6	6	9381	9386	100 %	0 %	0 %	0 %	116326546
89	NC_008504	AGA	2	6	9391	9396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326546
90	NC_008504	TGG	2	6	9416	9421	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116326546
91	NC_008504	GAT	2	6	9439	9444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116326546

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.